Футбольный клуб «СДЮСШОР-Вологда» создан в 2016 году на базе вологодской СДЮСШОР №3 по футболу. Клуб призван объединить воспитанников СДЮСШОР №3, их родителей, тренерско-преподавательский состав школы общей целью — стремлением к самым высоким футбольным вершинам.